あくまでVOコーディングの話なので、ミラー角度とか、アイドリングストップのデフォルト値の変更など元々ある設定を変えるくらいは問題ない気がします。
他の方によると、型式認定の話しで、不正改造にあたる可能性で問題になるのではということでした。
あとは有料でApplePlayとかサブスクで提供してるので、それをコード改造で無料で使えるようにすると無料で不正使用とかにあたるんじゃないでしょうかね。
私もあくまでWrightCompanyさんの記事で知って詳しいわけではないので法的根拠まではわからないですね。